cPanel 和 WHM 在/scripts 資料夾中提供了大量預先定義的指令碼。可用指令碼如下：
檢查 ImageMagick 是否已經安裝
/scripts/checkimagemagick
安裝 imagemagick
/scripts/installimagemagick
更新 cpanel
/scripts/upcp –force
檢查 perl 模組
/scripts/checkperlmodules
重啓 cpanel
/etc/init.d/cpanel restart
檢視 php.ini 位置
php -i | grep php.ini
修復 horde
/scripts/fullhordereset 或者/usr/local/cpanel/bin/update-horde –force
修復 roundcube
/usr/local/cpanel/bin/update-roundcube –force
復 squirrelmail
/usr/local/cpanel/bin/update-squirrelmail –force
安裝最新版本的 exim
/scripts/betaexim
尋找大小接近 2GB 的日誌
/scripts/biglogcheck
重建 exim.conf
/scripts/buildeximconf
檢視/usr/local/apache/conf/httpd.conf 檢測不良使用者
/scripts/checkbadconf
檢測 GD 是否支援
/scripts/checkgd
安裝 GD
/scripts/installgd
檢測 Apache 是否已達到允許的最多客户端
/scripts/checkmaxclients
檢測你係統上的 Perl 版本是否已經過時
/scripts/checkoldperl
檢測以確認 rsync 是最新的
/scripts/checkrsync
確認 yum 已正確設定
/scripts/checkyum
清空老的頻寬日誌
/scripts/cleanbw
清空老的 GD 安裝並重新安裝 GD
/scripts/cleangd
刪除一個 mySQL 資料庫
/scripts/dropmysqldb
升級 Apache
/scripts/easyapache
修改使用者的定額
/scripts/editquota
安裝/更新 exim
/scripts/eximup
檢測你的 php 版本檔案是不是最新的
/scripts/findphpversion
更新 proftpd
/scripts/fixproftpddupes
修復 quotas, 有時候使用者的配額會顯示 0 則需要執行以下指令碼
/scripts/fixquotas
檢測所有使用者的配額（空間佔用量）
/scripts/ftpquaotacheck
