cPanel 和 WHM 在/scripts 资料夹中提供了大量预先定义的指令码。可用指令码如下：
检查 ImageMagick 是否已经安装
/scripts/checkimagemagick
安装 imagemagick
/scripts/installimagemagick
更新 cpanel
/scripts/upcp –force
检查 perl 模组
/scripts/checkperlmodules
重启 cpanel
/etc/init.d/cpanel restart
检视 php.ini 位置
php -i | grep php.ini
修复 horde
/scripts/fullhordereset 或者/usr/local/cpanel/bin/update-horde –force
修复 roundcube
/usr/local/cpanel/bin/update-roundcube –force
复 squirrelmail
/usr/local/cpanel/bin/update-squirrelmail –force
安装最新版本的 exim
/scripts/betaexim
寻找大小接近 2GB 的日志
/scripts/biglogcheck
重建 exim.conf
/scripts/buildeximconf
检视/usr/local/apache/conf/httpd.conf 检测不良使用者
/scripts/checkbadconf
检测 GD 是否支援
/scripts/checkgd
安装 GD
/scripts/installgd
检测 Apache 是否已达到允许的最多客户端
/scripts/checkmaxclients
检测你系统上的 Perl 版本是否已经过时
/scripts/checkoldperl
检测以确认 rsync 是最新的
/scripts/checkrsync
确认 yum 已正确设定
/scripts/checkyum
清空老的频宽日志
/scripts/cleanbw
清空老的 GD 安装并重新安装 GD
/scripts/cleangd
删除一个 mySQL 资料库
/scripts/dropmysqldb
升级 Apache
/scripts/easyapache
修改使用者的定额
/scripts/editquota
安装/更新 exim
/scripts/eximup
检测你的 php 版本档案是不是最新的
/scripts/findphpversion
更新 proftpd
/scripts/fixproftpddupes
修复 quotas, 有时候使用者的配额会显示 0 则需要执行以下指令码
/scripts/fixquotas
检测所有使用者的配额（空间占用量）
/scripts/ftpquaotacheck
