在企業網站的網頁設計方面所存在的問題也直接影響到網站的性，甚至對企業形象造成負面影響。由於網頁設計問題非常之多，不可能進行完整的統計，《大型企業網路營銷狀況研究報告》(馮英健著) 僅對部分重要問題進行了調查分析，但並未進行詳細的數
據統計，這裡針對較為普遍存在的問題給出定性說明。
為了詳細說明企業網站規劃和網頁設計中所存在的問題，《大型企業網路營銷狀況研究報告》分類羅列這些常見的問題：
網站規劃：
·整體規劃不合理，主輔選單不清晰；
·網站建設導向不明確，重點不突出；
·欄目過多或者過少；
·各欄目缺乏統一規劃，整個網站比較雜亂；
·網站的促銷功能沒有得到明顯體現。
選單設定：
·選單採用圖片形式，圖示標識不明確，無文字說明，需要多使用者移動滑鼠進行猜測；
·選單層次過多，有效資訊層次太深，需要多次點選才能找到有效資訊；
·過多采用滑鼠響應式選單，欄目設定不合理，使得多使用者難以發現需要的資訊；
·欄目設定有重疊；
·欄目名稱意義不明確，容易造成混淆；
·全 flash 頁和選單，無法最佳化處理，也沒有相應的文字說明；
·欄目過於簡單，重要資訊不完整，有效資訊少。
網站頁：
·採用大型圖片或者 FLASH，真正多使用者關心的資訊在頁沒有體現，需要多次點選；
·過大的 FLASH 嚴重影響頁下載速度；
·頁有效資訊量小；
·頁無標題；
·主頁佈局比較亂，重要資訊沒有得以重點體現；
·開啟網頁彈出多個視窗，影響正常瀏覽；
·追求 “創意” 效果，很難理解網站要表達的意思。
頁面資訊：
·重要資訊不完整，如聯絡方式和產品介紹等；
·頁面資訊小，需要多次翻頁；
·與企業形象、產品、促銷等方面無關的資訊；
·產品詳細介紹內容過少；
·內容頁面沒有標題，或者全部使用公司名為標題；
·部分內容陳舊，缺乏時效性；
·部分欄目無任何內容。
網頁字型和美工：
·過分注重美術效果，大量採用圖片，影響網頁下載速度；
·過分注重美觀，有些連基本資訊內容都用圖片格式，影響基本資訊獲取；
·文字太小、文字顏色暗淡、採用深色頁面背景等，影響正常視覺；
·頁面過於花哨，接近於遊戲網站。